MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT51

Total Repeats: 992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017204	A	6	6	105	110	100 %	0 %	0 %	0 %	384183549
2	NC_017204	GTC	2	6	155	160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183549
3	NC_017204	AAC	2	6	191	196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183549
4	NC_017204	AT	3	6	200	205	50 %	50 %	0 %	0 %	384183549
5	NC_017204	AGA	3	9	231	239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
6	NC_017204	AGC	2	6	242	247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183549
7	NC_017204	AGA	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
8	NC_017204	AGA	2	6	309	314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
9	NC_017204	GCT	2	6	325	330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183549
10	NC_017204	ATG	2	6	371	376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183549
11	NC_017204	AAG	2	6	443	448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
12	NC_017204	TGA	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183549
13	NC_017204	GAA	2	6	502	507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
14	NC_017204	GAT	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183549
15	NC_017204	TAT	2	6	603	608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183549
16	NC_017204	TTC	2	6	625	630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183549
17	NC_017204	A	6	6	652	657	100 %	0 %	0 %	0 %	384183549
18	NC_017204	AAT	2	6	757	762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183549
19	NC_017204	TGA	2	6	792	797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183549
20	NC_017204	TTCT	2	8	809	816	0 %	75 %	0 %	25 %	384183549
21	NC_017204	GGT	2	6	826	831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183549
22	NC_017204	AGA	2	6	849	854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
23	NC_017204	AG	3	6	867	872	50 %	0 %	50 %	0 %	384183549
24	NC_017204	A	6	6	892	897	100 %	0 %	0 %	0 %	384183549
25	NC_017204	TAT	2	6	908	913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183549
26	NC_017204	GCT	2	6	973	978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183549
27	NC_017204	AGG	2	6	986	991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183549
28	NC_017204	AGA	2	6	1008	1013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
29	NC_017204	CTA	2	6	1052	1057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183549
30	NC_017204	AGA	2	6	1110	1115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
31	NC_017204	GAA	2	6	1126	1131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
32	NC_017204	GCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183549
33	NC_017204	TGC	2	6	1197	1202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183549
34	NC_017204	GAA	2	6	1231	1236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
35	NC_017204	ACA	2	6	1248	1253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183549
36	NC_017204	A	7	7	1260	1266	100 %	0 %	0 %	0 %	384183549
37	NC_017204	CAA	2	6	1323	1328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183550
38	NC_017204	TTA	2	6	1329	1334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183550
39	NC_017204	TAC	2	6	1364	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183550
40	NC_017204	TCT	2	6	1380	1385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183550
41	NC_017204	TTA	2	6	1389	1394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183550
42	NC_017204	TC	3	6	1447	1452	0 %	50 %	0 %	50 %	384183550
43	NC_017204	GGC	2	6	1512	1517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384183550
44	NC_017204	ATACA	2	10	1589	1598	60 %	20 %	0 %	20 %	384183550
45	NC_017204	AGA	2	6	1628	1633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183550
46	NC_017204	TGAAGG	2	12	1652	1663	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384183550
47	NC_017204	ATC	2	6	1745	1750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183550
48	NC_017204	GAA	2	6	1784	1789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183550
49	NC_017204	ATT	2	6	1815	1820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183550
50	NC_017204	GAA	2	6	1851	1856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183550
51	NC_017204	AAAT	2	8	1913	1920	75 %	25 %	0 %	0 %	384183550
52	NC_017204	TTA	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183550
53	NC_017204	TAAA	2	8	2041	2048	75 %	25 %	0 %	0 %	384183550
54	NC_017204	CTT	2	6	2077	2082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183550
55	NC_017204	ATT	3	9	2094	2102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183550
56	NC_017204	ACA	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183550
57	NC_017204	TGA	3	9	2216	2224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183550
58	NC_017204	AGT	2	6	2467	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183551
59	NC_017204	TGC	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183551
60	NC_017204	AAG	2	6	2529	2534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183551
61	NC_017204	AAG	2	6	2595	2600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183551
62	NC_017204	AAG	2	6	2606	2611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183551
63	NC_017204	GAAA	2	8	2614	2621	75 %	0 %	25 %	0 %	384183551
64	NC_017204	AGA	2	6	2669	2674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183552
65	NC_017204	AAG	2	6	2762	2767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183552
66	NC_017204	CTTT	2	8	2794	2801	0 %	75 %	0 %	25 %	384183552
67	NC_017204	CTG	2	6	2804	2809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183552
68	NC_017204	ATG	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183552
69	NC_017204	GAA	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183552
70	NC_017204	TAT	2	6	2970	2975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183552
71	NC_017204	GTT	2	6	2983	2988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183552
72	NC_017204	AGT	2	6	2994	2999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183552
73	NC_017204	ATT	2	6	3050	3055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183552
74	NC_017204	ACAA	2	8	3094	3101	75 %	0 %	0 %	25 %	384183552
75	NC_017204	GAT	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183553
76	NC_017204	GAT	2	6	3189	3194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183553
77	NC_017204	TA	3	6	3196	3201	50 %	50 %	0 %	0 %	384183553
78	NC_017204	GTA	3	9	3210	3218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183553
79	NC_017204	ACT	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183553
80	NC_017204	CTG	3	9	3313	3321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183553
81	NC_017204	AT	3	6	3372	3377	50 %	50 %	0 %	0 %	384183553
82	NC_017204	GAA	2	6	3429	3434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183553
83	NC_017204	ATC	2	6	3493	3498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183553
84	NC_017204	TG	3	6	3601	3606	0 %	50 %	50 %	0 %	384183554
85	NC_017204	CAG	2	6	3619	3624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183554
86	NC_017204	AAG	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183554
87	NC_017204	CTG	2	6	3742	3747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183554
88	NC_017204	A	6	6	3834	3839	100 %	0 %	0 %	0 %	384183554
89	NC_017204	ATG	2	6	3930	3935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183554
90	NC_017204	ATA	2	6	3996	4001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183555
91	NC_017204	GAT	2	6	4071	4076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183555
92	NC_017204	AAT	2	6	4113	4118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183555
93	NC_017204	TAGA	2	8	4228	4235	50 %	25 %	25 %	0 %	384183555
94	NC_017204	GAT	2	6	4251	4256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183555
95	NC_017204	GTA	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183555
96	NC_017204	TCAT	2	8	4315	4322	25 %	50 %	0 %	25 %	384183555
97	NC_017204	ATTA	2	8	4394	4401	50 %	50 %	0 %	0 %	384183556
98	NC_017204	ACT	2	6	4419	4424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183556
99	NC_017204	TAT	2	6	4539	4544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183556
100	NC_017204	TTA	2	6	4593	4598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183556
101	NC_017204	AACTGA	2	12	4688	4699	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384183556
102	NC_017204	GTT	2	6	4818	4823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183556
103	NC_017204	TCT	2	6	4824	4829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183556
104	NC_017204	GGTT	2	8	4862	4869	0 %	50 %	50 %	0 %	384183556
105	NC_017204	ACC	2	6	4916	4921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183556
106	NC_017204	AAAGAA	2	12	4940	4951	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384183556
107	NC_017204	A	6	6	5061	5066	100 %	0 %	0 %	0 %	384183557
108	NC_017204	TGA	2	6	5067	5072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183557
109	NC_017204	CGA	2	6	5117	5122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183557
110	NC_017204	ATT	2	6	5156	5161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183557
111	NC_017204	AAGC	2	8	5213	5220	50 %	0 %	25 %	25 %	384183557
112	NC_017204	AGC	2	6	5239	5244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183557
113	NC_017204	AGA	3	9	5257	5265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183557
114	NC_017204	AGC	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183557
115	NC_017204	GAT	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183557
116	NC_017204	GAT	2	6	5360	5365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183557
117	NC_017204	TAAAAG	2	12	5391	5402	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384183557
118	NC_017204	GAA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183557
119	NC_017204	T	6	6	5482	5487	0 %	100 %	0 %	0 %	384183557
120	NC_017204	CAG	3	9	5538	5546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183557
121	NC_017204	ATGG	2	8	5639	5646	25 %	25 %	50 %	0 %	384183558
122	NC_017204	GAT	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183558
123	NC_017204	AGC	2	6	5717	5722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183558
124	NC_017204	AAG	2	6	5723	5728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183558
125	NC_017204	GAA	2	6	5742	5747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183558
126	NC_017204	GAA	2	6	5782	5787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183558
127	NC_017204	TAC	2	6	5790	5795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183558
128	NC_017204	AGA	2	6	5883	5888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183558
129	NC_017204	AAG	2	6	5927	5932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183558
130	NC_017204	ACA	2	6	6061	6066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183559
131	NC_017204	TGC	2	6	6214	6219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183559
132	NC_017204	TCT	2	6	6269	6274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183559
133	NC_017204	GAA	2	6	6413	6418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183559
134	NC_017204	AGA	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183559
135	NC_017204	GTG	2	6	6489	6494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183559
136	NC_017204	TTC	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183559
137	NC_017204	ATTT	2	8	6543	6550	25 %	75 %	0 %	0 %	384183559
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142	NC_017204	TAAAGG	2	12	6820	6831	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384183559
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151	NC_017204	ATG	2	6	7511	7516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183559
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163	NC_017204	A	6	6	8055	8060	100 %	0 %	0 %	0 %	384183559
164	NC_017204	AAAG	2	8	8107	8114	75 %	0 %	25 %	0 %	384183559
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167	NC_017204	TTG	2	6	8292	8297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183559
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175	NC_017204	GTT	2	6	8576	8581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183559
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254	NC_017204	TAT	2	6	12881	12886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183565
255	NC_017204	TAC	2	6	12915	12920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183565
256	NC_017204	AAGT	2	8	12923	12930	50 %	25 %	25 %	0 %	384183565
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260	NC_017204	CAAA	2	8	13048	13055	75 %	0 %	0 %	25 %	384183565
261	NC_017204	TGG	2	6	13057	13062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183565
262	NC_017204	TGA	2	6	13095	13100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183565
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265	NC_017204	ATA	2	6	13130	13135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183565
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269	NC_017204	ATT	2	6	13378	13383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183565
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272	NC_017204	CTG	2	6	13772	13777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183565
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282	NC_017204	ATA	2	6	14449	14454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183566
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294	NC_017204	ATT	2	6	14886	14891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183566
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368	NC_017204	TGTT	2	8	18458	18465	0 %	75 %	25 %	0 %	384183568
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370	NC_017204	ACC	2	6	18530	18535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183568
371	NC_017204	TTAT	2	8	18550	18557	25 %	75 %	0 %	0 %	384183568
372	NC_017204	GCT	2	6	18567	18572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183568
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384	NC_017204	AAAG	2	8	19068	19075	75 %	0 %	25 %	0 %	384183568
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388	NC_017204	GGC	2	6	19284	19289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384183568
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390	NC_017204	T	6	6	19425	19430	0 %	100 %	0 %	0 %	384183568
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392	NC_017204	GTT	2	6	19473	19478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183568
393	NC_017204	ATT	2	6	19527	19532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183568
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400	NC_017204	GAA	2	6	19704	19709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183568
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491	NC_017204	TA	3	6	25072	25077	50 %	50 %	0 %	0 %	384183574
492	NC_017204	TATGTG	2	12	25093	25104	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384183574
493	NC_017204	GAC	2	6	25680	25685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183575
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499	NC_017204	TTG	2	6	26167	26172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183576
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